일반 야생 포켓몬과의 배틀 이외에 야생 보스 포켓몬, 일반 트레이너, 라이벌, 체육관 관장, 사천왕, 챔피언, 악의 조직과의 배틀, 그리고 미스터리 조우가 존재한다.
융합체 해제시 기존 능력치가 절반이 되는 디버프가 존재한다. 그렇기에 초반융합체를 해제시키고 쓸어담는 플레이는 불가능하다.
능력치가 바뀌는 반전 챌린지도 일반 클래식과는 밸런스와 공략법이 상당히 다르다. 능력치만 변경되고 자력기 및 기술머신으로 배우는 기술 등은 그대로라 몇몇 포켓몬들은 일반 클래식보다 훨씬 좋을 수도 있고 그렇지 않을 수도 있다.
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해당 성격이 어떤 능력치를 올려주고 내려주는지 보여주는 만큼 잘못 사용할 일은 없을 것이다. 포켓몬의 능력치 화면에서 붉은 글자로 된 능력치가 상승 능력치이고 파란 글자로 된 능력치가 하락 능력치이니 참고하자.
갸차 뽑기 시스템: 가챠를 통해 게임 플레이를 통해 얻은 바우처로 포켓몬 알을 뽑을 수 있습니다.
알을 선택시 나오는 메시지는 남은 웨이브를 대략적으로 보여주며, 그 관계는 다음과 같다.
따라서 최종 로스터는 캐리몬 / 메버몬 / 코롱몬 / 토중몬 / 다크홀몬 / 마룻바닥몬이다.
다만 종이신도와 마찬가지로 내구가 매우 허약하다 보니 원킬을 못낸다면 바로 비상이 걸리는 데다, 선공기 아쿠아제트나 기습에 약점을 찔려 누워버릴 위험도 있다.
가중치는 각각의 희귀도에서 해당 아이템이 등장할 확률을 설정한 값으로, 가중치가 높을 수록 등장할 확률이 높다. 한 등급에서 특정 아이템이 등장할 확률은 (해당 아이템의 현재 가중치 / 동일 등급의 모든 아이템의 가중치의 총합) 으로, 조건에 따라 아이템의 가중치가 증감하기 때문에 다른 아이템이 뜨지 않을 조건을 만들면 원하는 아이템을 띄울 확률이 높아진다.
메가니움 - 메가니움의 고질적 단점이던 내구형 설계가 어태커형으로 바뀌면서 알 기술 용의춤과 조합해서 사용하면 원본에 비해 훨씬 쓸만해졌다.
융합에 사용된 두 번째 포켓몬은 사라지고 첫 번째 포켓몬에 흡수된 것으로 취급된다.
던지미는 진입 자체가 힘든 도장에서만 등장하는데다 일반 웨이브에선 레어 등급이고, 개굴닌자는 그나마 자주 들리는 호수에서 나오긴 하지만 여기에서 확인 일반, 보스 웨이브 둘 다 레어 등급이라 이쪽도 자주 등장하는 편이 아니다. 때문에 남는 이로치 꿀모으기, 픽업몬 자리에 대신 이들을 데려갈지, 아니면 야생에서 운좋게 먹는 방법을 택할지는 선택 사항이다.
자세한 설명은 하단의 테라스탈 오브 항목으로. 소모 아이템이다. 스텔라 테라피스를 획득하면 숨겨진 도전과제가 열린다. 일부 포켓몬은 테라스탈타입이 고정되어 있어 특정 타입의 테라피스를 적용할 수 없다.